Освоение содержания программы способствует развитию у детей способности по определению основных законов функционирования эко-биосистем различного уровня во взаимосвязи с окружающей средой, умения их использования в своей повседневной жизни, что является необходимым для формирования у школьников экологического мировоззрения, воспитания навыков экологической культуры и способности оценивать свою деятельность с точки зрения охраны биосферы.
Программа «Экостем» знакомит подростков с ролью экологии и экологов в современном мире, с перспективами развития современной науки в области биотехнологии и агроэкологии; методами оценки качества окружающей среды; стратегиями устойчивого развития, рационального природопользования и «зелёной экономики»; проблемами урбанизированных территорий и перспективами их решения; проблемами хранения и переработки отходов; технологиями производства экологически чистых продуктов питания, принципами защиты окружающей среды; основами статистической обработки данных в экологии.