Во время проведения занятий, помимо игровых приемов, каждый педагог использует самые разнообразные методы обучения: объяснение материала, постановка и решение проблемной ситуации, беседа, работа со словарем, а также большое количество наглядно-демонстрационного и раздаточного материала: символы звуков, слов, счетный материал, предметные и сюжетные картинки, головоломки, ребусы, интеллектуальные игры: танграм, блоки Дьенеша, таблицы Зака, лекала, линейки-трафареты, индивидуальные «шершавые цифры» для развития тактильной памяти, цветные ручки, прописи, произведения художественной литературы и фольклора и т.д. Все это позволяет вызвать у детей устойчивый интерес к обучению и желание учиться, узнавать новое, что и является истиной мотивацией к обучению.
Во время общения детей с педагогом и со сверстниками на занятиях тренируются коммуникативные процессы (дети занимаются в группах коллективно, в парах, индивидуально), которые в настоящее время особенно значимы.
Все занятия построены с учетом здоровье-сберегающего принципа обучения: физкультминутки, пальчиковая гимнастика, частая смена видов деятельности и т.п.
Каждый блок программы взаимосвязан, дополняет друг друга и предполагает контрольные срезы, которые помогают увидеть педагогу зону актуального развития каждого ребенка и определить зону ближайшего развития каждого ребёнка.
Ребенок, прошедший курс программы «Знайка», как правило, готов и хочет занять «позицию ученика».